Водоплавающие птицы создают людям много проблем. Портовые сооружения, причалы, элементы осветительных конструкций и ограждений, расположенные на них, являются местами отдыха и наблюдения, а иногда и гнездования птиц. Это приводит к загрязнению этих мест. Чайки и бакланы поедают рыбу в прудовых хозяйствах и являются переносчиками ее инвазионных болезней. Птицы загрязняют яхты, портят чехлы, которые используются для их укрытия.
    Для защиты акваторий и сооружений используются биоакустические приборы. Эксперименты, проводившиеся министерством сельского хозяйства США во Флориде на акваториях для разведения рыбы, показали, что использование приборов Bird Gard позволяет практически полностью исключить потери. 
    На причалах, элементах конструкций, хорошо применять противоприсадные устройства и визуальные средства защиты.
    Для защиты небольших водоемов прекрасными средством являются закрепленные в воде шары с имитацией глаз хищной птицы.